Setan Amnesia mengisahkan Imelda Dewindya Farensky (Imel), siswi kelas XI yang tiba-tiba mendapati dirinya berada di tempat gelap dan mencekam. Ketika tersadar, ia berdiri di depan kelasnya, namun tak seorang pun menyadari kehadirannya. Gurunya bahkan mengumumkan bahwa Imel telah meninggal tiga hari sebelumnya.

Kebingungan Imel terjawab saat ia bertemu Nandika Lafanzo (Dika), seorang “malaikat setan” yang membimbing arwah baru. Dika menjelaskan bahwa Imel telah meninggal dan kini menjadi setan pemula yang mengalami amnesia, lupa akan penyebab kematiannya.

Untuk mengetahui penyebab kematiannya, Imel harus menjalani serangkaian ujian di sekolah setan. Dalam perjalanannya, ia bertemu berbagai makhluk gaib dari berbagai budaya, seperti kuntilanak, pocong, vampire, dan mummy.