Pengaruh utama dalam kehidupan Will Burrows yang berusia empat belas tahun adalah ayahnya, Dr. Burrows, dan bersama-sama mereka berbagi minat dalam arkeologi dan ketertarikan pada masa lalu yang terkubur. Ketika Dr. Burrows mulai memperhatikan ‘orang-orang pucat’ aneh di tempat mereka tinggal di Highfield, dan kemudian segera menghilang, Will dan temannya Chester pergi mencarinya. Mereka menemukan lorong yang terhalang di belakang rak buku di ruang bawah tanah rumah Burrows dan menggalinya kembali, menemukan lorong itu mengarah ke pintu yang tertanam di batu, dan di balik pintu itu ada lift tua yang membawa mereka ke serangkaian pintu lain. Jalan berbatu terletak di luar, diterangi oleh deretan lampu jalan seperti bola; rumah-rumah yang tampaknya diukir dari dinding itu sendiri mengapit jalan.

Mereka segera ditangkap oleh polisi komunitas bawah tanah, yang dikenal sebagai Koloni. Di penjara, Will dikunjungi oleh Tn. Jerome, dan putranya Cal. Mereka mengungkapkan bahwa Will sebenarnya lahir di Koloni, dan bahwa mereka adalah keluarga aslinya; Tn. Jerome ayahnya, dan Cal adik laki-lakinya. Will akhirnya dibebaskan dari penjara dan dibawa ke rumah Jerome, di mana Will dan Paman Cal Tam senang melihatnya dan memberi tahu Will bahwa ayah angkatnya, Dr. Burrows, baru-baru ini ada di sana, dan telah dengan sukarela melakukan perjalanan ke Deeps – tempat yang bahkan lebih dalam di Bumi daripada Koloni. Will mengetahui bahwa Styx, penguasa agama Koloni, akan memperbudak Chester atau mengusirnya ke Deeps untuk berjuang sendiri. Will menolak untuk meninggalkan temannya, dan Paman Tam merumuskan rencana baginya untuk menyelamatkan Chester dan membawanya kembali ke permukaan.

Will dan Cal mencoba menyelamatkan Chester sebelum ia dikirim ke dasar laut dengan ‘Kereta Penambang’, tetapi Styx datang dan mereka terpaksa meninggalkan Chester. Selama upaya pelarian yang gagal, terungkap bahwa Rebecca, saudara angkat Will, sebenarnya adalah Styx yang ditanamkan dalam keluarganya untuk mengawasinya. Anak-anak lelaki itu melewati serangkaian terowongan menuju Kota Abadi, sebuah kota batu tua, yang diperkirakan oleh Will berasal dari zaman Romawi, di mana udaranya dipenuhi dengan bio-toksin yang mematikan. Mereka menghindari tentara Styx, yang berpatroli di kota dengan anjing-anjing penguntit mereka yang ganas, dan akhirnya muncul di tepi Sungai Thames. Will pulang ke rumahnya di Highfield, tetapi di sana kesehatan Will memburuk, jadi Cal membantunya ke flat Bibi Jean tempat ia pulih. Segera mereka kembali ke bawah tanah untuk menemukan ayah angkat Will dan mencoba menyelamatkan Chester sekali lagi. Mereka bertemu dengan patroli Styx lainnya, dan Paman Tam membunuh seorang anggota Styx, yang ia panggil Crawfly, tetapi terluka parah dalam pertarungan itu. Paman Tam yang keras kepala memilih untuk tetap tinggal untuk memberi waktu bagi anak-anak lelaki itu untuk melarikan diri. Dengan bantuan Imago Freebone, anggota geng Paman Tam, Will dan Cal melarikan diri ke tempat persembunyian kecil di tengah-tengah antara Koloni dan Kota Abadi. Di sana, mereka beristirahat dan berduka untuk Paman Tam; dan diberi tahu oleh Imago bahwa kereta Chester ke Deeps akan segera melewati tepat di bawah tempat persembunyian mereka. Mereka melompat ke dalam kereta melalui sebuah lubang di lantai tempat persembunyian dan menemukan Chester. Bersama-sama mereka berkendara ke Deeps. Dalam epilog buku itu, Rebecca membunuh Imago, yang bersembunyi di permukaan, dengan racun.